在寒冬的2002年,横滨大桥突然遭受战机的猛烈轰炸,媒体声称此举源自自卫队的行动。然而,事实上,这样的一架战机根本就不存在。这一事件引发了公众对自卫队的广泛不信任。特车二课第二小队的领袖后藤队长敏锐地意识到这一切与自卫队失踪的队员柘植有关。回到1999年,日本陆上自卫队的机械战队在一次联合国维和行动中全军覆没。而柘植,曾是特车二课第一小队队长南云的挚爱。公众的疑虑达到了顶峰,东京被戒严,骚乱一触即发,人们深陷即将来临的战争阴影。在自卫队王牌队员荒川的协助下,后藤和南云终于找到了柘植的踪迹。后藤召集了泉、篠原等特车二课的成员,启动PATLABOR机器人,决意进攻柘植的根据地。这部影片是导演押井守呈现的《机动警察PATLABOR》系列的第二部剧场版,将带领观众探索日本社会中的阴谋与矛盾。